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Arbregen

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Brève présentation du logiciel Arbres généalogiques.

Vous trouverez des explications plus complètes dans l'aide qui accompagne le programme.

Arbregen permet de construire des arbres généalogiques puis de donner une valeur approchée pour les probabilités des différents génotypes. Le caractère est supposé lié à un seul gène représenté par deux allèles. Le mode de transmission peut être autosomal ou lié au sexe, dominant ou récessif.
Le calcul "à la main" est possible mais devient vite très difficile dès que l'arbre gagne en complexité.

Principe

Le programme ne fait pas d'hypothèse à priori sur les génotypes autres que celles qui sont imposées lors de la construction de l'arbre (mode de transmission, phénotypes et sexes connus, probabilités d'être hétérozygote pour les individus en 'frontière' de l'arbre). Pour chaque individu il tire au sort un génotype compatible avec ces contraintes puis en tire les conséquences pour sa descendance. Si à un moment quelconque une contradiction apparaît (par exemple, un des deux parents 'tire' un génotype homozygote normal alors qu'un de ses enfants est atteint) l'arbre est déclaré impossible et un autre arbre est calculé. Si un arbre est possible, il est pris en compte pour le calcul des probabilités des différents génotypes. Par exemple, sur 100000 arbres calculés, 1000 s'avèrent être possibles, sur ces 1000 arbres, l'individu II-2 a été 600 fois hétérozygote, 400 fois homozygote normal, sa probabilité d'être hétérozygote est donc de 60%. Le calcul est effectué sur un ou plusieurs modes de transmission suivant le choix effectué.

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